Eugenija Martinaitytė gimė Kaune, nuo 1955 gyvena Vilniuje. Baigė KTU, inžinierė-ekonomistė, socialinių mokslų daktarė, docentė. Dirba Mykolo Romerio universitete, vadovauja magistrantams ir doktorantams. Įtraukta į Lietuvos ir JAV enciklopedijas.
Tapyti pradėjo apie 1970-uosius metus. Nuo 1979 metų – lanko Vilniaus ,,Taurakalnio“ tapybos studiją. 1981 m. įstojo į Lietuvos tautodailininkų sąjungos Vilniaus bendriją, vėliau tapo Vilniaus krašto tautodailininkų – meno kūrėjų bendrijos nare.

2015 metais LR kultūros ministro įsakymu tapytojai Eugenijai Martinaitytei suteiktas meno kūrėjo statusas.  Dalyvauja respublikinėse, regioninėse ir grupinėse parodose, surengė keturias asmenines parodas. Mėgstami motyvai: Žvėryno, Neringos, kaimo peizažai, Vilniaus panoramos. Tapymo technika – tempera, aliejus, akrilas.